为什么心脏总是长在左边?生物手性原理在起作用

2024年08月13日 08:12 次阅读 稿源:cnBeta.COM 条评论

为什么大多数人的心脏略微偏向身体左侧?为什么DNA几乎总是右旋?构成蛋白质的α螺旋也是如此。手性(或称"手性")在生物学中无处不在,但其背后的原因却常常是个谜。对非对称六方金刚石--狮身人面像瓦的最新研究表明,它能够创造出复杂、可扩展的图案,阐明了生物学中手性的基本原理,解释了特定分子和生理取向的偏好。

格雷格-胡贝尔(Greg Huber)是一位生物物理学家,也是旧金山陈-扎克伯格生物中心(Chan Zuckerberg Biohub San Francisco)的研究员,他花了三年时间,利用一种生活在三角形晶格上的简单不对称形状--狮身人面像瓦--来探索这些问题以及更多问题。他和他的合作者克雷格-克内希特(Craig Knecht)、沃尔特-特朗普(Walter Trump)和罗伯特-齐夫(Robert Ziff)发现了与它的手性有关的意想不到的特性。他们的研究最近发表在《物理评论研究》杂志上。

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狮身人面像瓷砖是不对称的,而且是"复制瓷砖",这意味着它的形状可以由重复的、更小的副本组成。图片来源:Huber 等人,《物理评论研究》,2024 年

狮身人面像由六个等边三角形(六角形)组成,具有内在的手性,有左旋和右旋两种方向。它是目前已知的唯一一种非对称六面体,可以与自身的每一阶拼接,也就是说,所有按 n 倍缩放的狮身人面像都可以被 n-n 个更小的单位狮身人面像拼接。换句话说,一个 2 阶狮身人面像可以由 4 块狮身人面像砖拼成,一个 3 阶狮身人面像可以由 9 块狮身人面像砖拼成,以此类推。从单个单位狮身人面像开始,可能的瓷砖排列或布局数量一开始很少:1、1、4、16、......,但不会持续太久。

随着拼图中狮身人面像数量的增加,可能的布局数量也呈超指数增长。例如,阶 5 的狮身人面像有 153 种可能的布局(如下图所示),阶 6 的狮身人面像有近 72 000 种布局,阶 13 的狮身人面像则多达1030 种,即 10 到 30 的阶数!(也就是一个 1 加上 30 个零)。

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具有低手性能量的 23 阶狮身人面像(左图,左手狮身人面像为蓝色,右手狮身人面像为红色)和具有高手性能量的 23 阶狮身人面像(右图)。来源:Huber 等人,《物理评论研究》,2024 年

瓷砖的不对称为探索手性提供了丰富的途径。就拿把两块瓷砖并排放置这个简单的问题来说吧。两块狮身人面像瓷砖可以有 46 种(或 47 种,取决于你如何计算)不同的方式组成一个对偶体。(相比之下,两个单位方格只有一种方式可以组成一个对偶体)。

而且,它们可以拼成具有低手性能量的形状,这意味着大多数相邻的狮身人面像都具有相同的方向或高手性能量。

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由 25 块较小的狮身人面像瓷砖组成的 5 阶狮身人面像有 153 种可能的瓷砖排列方式。图片来源:Huber 等人,《物理评论研究》,2024 年

旧金山生物中心理论组组长休伯强调,这项工作不仅仅是抽象的练习。他指出,几何和手性都与生物学有着重要的联系,但往往被忽视。例如,病毒外壳具有基于相同晶格的几何对称性("准等价原理")。

"宇宙不应该偏爱一种手性而不是另一种手性,但在一个又一个尺度上,手性偏好出现了,"Huber 说。"手性可能非常神秘,而狮身人面像瓷砖令人惊讶的手性相互作用正是这项工作的动机。"

编译自/ScitechDaily

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