尽管拥有强悍的定制处理器，超长的续航表现，但Surface Pro X的短板之一就是软件生态。适用于Windows 10 on ARM的现有微软模拟技术并不支持64位x86应用程序，以至于Pro X等设备无法运行各种主流应用程序。不过援引外媒NeoWin报道，微软正着手解决这个兼容性问题。微软计划在Windows 10 21H1（2021年上半年发布）功能更新中，让Windows 10 on ARM支持运行x64应用程序。
报道中写道：“从多方消息源获悉，可以确认微软内部正在将x64应用模拟器引入到Windows 10 on ARM平台上。目前尚不清楚会何时上线，但极大概率是Windows 10 21H1，也就是说在2021年上半年这项功能会向公众开放，Windows Insider会在明年测试这项功能。”
微软或高通公司都尚未对ARM 10上Windows 10上的x64应用程序仿真发表评论，并且仍然存在包括性能在内的诸多问题。例如此外，当既有32位版本又有64位版本的旧版应用程序可用时，将在ARM PC的Windows 10上下载哪个版本？在更多开发人员针对ARM64架构重新编译其应用程序之前，情况应该仍然令人困惑。