微软表示Windows 10X系统将通过容器方式，不仅可以支持大多数传统桌面应用程序，而且能确保操作系统免受恶意软件和性能下降的影响。不过微软也表示通过容器运行Win32应用会受到限制，部分权限无法获得支持。
这就意味着要么所有应用都能够访问诸如相机这样的隐私敏感硬件，要么所有都无法访问。用户无法在文件管理器中使用由第三方开发者设计的扩展或者插件。例如，能够移动和复制文件的实用应用TeraCop可能就无法在Windows 10X上使用。
同样，位于系统托盘中的应用程序（例如电池百分比应用程序，音量控制器或温度检测器）可能无法在10X上运行。微软表示当前没有计划支持系统任务栏插件、文件管理器加载项等等。此外微软还将会阻止钩子（hook）方式来截取键盘和鼠标的操作。
值得注意的是该操作系统是处于只读状态，并且是在锁定模式下设计的。操作系统可以运行从Microsoft Store外部下载的应用程序，但是这些应用程序必须具有良好的信誉和签名代码。而且您将无法使用注册表编辑器来优化Windows。